胃肠道中会出现一些细菌，而且细菌的种类很多，既有有益菌，也有一些有害菌。如果肠道细菌更加平衡，人们现在就会更健康。当某些因素造成胃肠道菌群失调时，往往会出现一些症状，如腹泻等，此时应及时加强治疗。
如何治疗胃肠道菌群失调
1、饮食调整：
发酵性腹泻应限制碳水化合物的摄入；腐败性腹泻应限制蛋白质摄入。为提高肠粘膜的天然屏障功能，防止细菌更替，应增加纤维食物。
2.抗菌药物：
应立即停用原有抗生素。应根据有益菌分析和药敏试验使用合适的抗生素，抑制细菌过度生长，从而间接支持胃肠道内生长不足的细菌。另外，可以使用广谱抗生素消灭大部分肠道细菌，然后注射所有正常肠道细菌的菌液使其恢复。
3、活菌中药制剂：
现阶段常见的活菌中药制剂有嗜酸乳杆菌、立陶宛乳杆菌、乳杆菌、芽孢乳杆菌、二叉乳杆菌、粪链球菌、大肠杆菌、粪链球菌、枯草芽孢杆菌等。其中，二叉乳杆菌中药制剂有效果最好。枯草芽孢杆菌中药制剂的功效也不错。其功效机制可能是因为该菌为需氧菌，能消化吸收氧气，降低肠道氧化还原反应电位差，适合铜绿假单胞菌（类链球菌、乳杆菌）的生长发育。这间接支持了所有正常细菌和有益细菌。还可以利用普通人的粪便悬浮液制成刺籽活菌中药制剂，用于治疗金黄色葡萄球菌引起的伪膜性结肠炎，并取得了良好的效果。由链球菌乳杆菌制成的乳糖酶已广泛应用于临床，并取得了良好的效果。中药制剂可以用胃肠道正常有益菌的耐药菌株制成，具有时间恒定性，也是调节胃肠道菌群失衡的有效方法。目前全新的医疗器械丽珠肠道（回春生胶香）是双歧链球菌活菌（bifidobiogne）的中药制剂。根据第一项药物研究，该中药制剂具有天然屏障作用和控制内霉素尿的作用。营养作用、抗肿瘤作用、免疫增强作用、抗衰老作用等。
4、有益菌硫化促进剂：
口服有益菌硫化促进剂也可以达到支持正常有益菌的目的。例如，乳糖用于支持肠杆菌科细菌，叶酸片用于支持肠球菌，儿童和青少年常见的分叉链球菌促进分叉乳杆菌的生长发育。使用半乳糖苷-水杨酸，细菌溶解后产生乳酸菌或冰醋酸，降低pH值，抑制其他细菌，支持乳酸菌生长。
5、耐药肠球菌中药制剂：
昆梅黑等人。日本等人采用增厚继代培养方法，获得耐链霉素、红霉素、四期、氨苄西林的肠球菌BIO-4R菌株。动物和人体实验表明，这种细菌对多种抗菌药物具有耐药性，因此可以阻止其他有益菌的异常生长，摆脱肠道菌群失衡，改善排便异常，比以往的治疗更有效单独使用抗菌药物。高效，可阻止粪链球菌BIO-4R菌株耐药因子向大肠杆菌K-12菌株迁移。